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Rougier, Lea. Dynamique et orientation de peptides transmembranaires : étude couplant calculs quantiques et RMN du solide

Rougier, Lea (2010) Dynamique et orientation de peptides transmembranaires : étude couplant calculs quantiques et RMN du solide.

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Résumé en francais

Ce mémoire montre une approche nouvelle, couplant calculs quantiques de propriétés RMN et expériences de RMN du solide. Le but est de mettre en place une méthodologie permettant de déterminer l'orientation et la dynamique de peptides modèles en membrane modèle, plus particulièrement pour le peptide WALP 23 en membrane de DMPC. Dans un premier temps, une étude complète a été menée sur les calculs quantiques de tenseurs d'anisotropies de déplacement chimique (CSA), afin de déterminer les éléments importants à prendre en compte dans ce type de calcul. Ces calculs ont ensuite été couplés à des mesures de RMN du solide, permettant de déterminer les paramètres d'orientation et de dynamique du peptide, en utilisant une approche qui consiste à prendre en compte différentes contraintes RMN. Dans un deuxième temps, une étude couplant calculs quantiques de tenseurs CSA et structures issues de dynamique moléculaire a été menée afin de prendre en compte des effets de dynamique interne du peptide.

Sous la direction du :
Directeur de thèse
Jolibois, Franck
Ecole doctorale:Sciences de la matière (SdM)
laboratoire/Unité de recherche :Laboratoire de Physique et Chimie des Nano-Objets (LPCNO), UMR 5215 ; Institut de Pharmacologie et de Biologie Structurale (IPBS), UMR 5089
Mots-clés libres :Tenseurs CSA - Peptide transmembranaire - Calculs quantiques - DFT - RMN du solide - Dynamique moléculaire - MACADAM
Sujets :Chimie
Déposé le :09 Sep 2011 10:22