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Nolivos, Sophie. Etude du mécanisme de résolution des dimères de chromosomes chez les streptocoques

Nolivos, Sophie (2010) Etude du mécanisme de résolution des dimères de chromosomes chez les streptocoques.

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Résumé en francais

La majorité des bactéries connues possèdent un unique chromosome circulaire. Lors de la réplication du chromosome, des évènements de recombinaison homologue peuvent lier les deux chromosomes frères en une molécule unique, appelée dimère de chromosome. Le système de recombinaison spécifique de site dédié à résoudre les formes dimériques en monomères est le système Xer. Il est composé chez la bactérie modèle Escherichia coli de deux recombinases à tyrosine, XerC et XerD, qui agissent sur un site chromosomique unique, dif, localisé dans la région du terminus de réplication. Le système de recombinaison Xer est sous le contrôle de la protéine septale FtsK. FtsK est une translocase à ADN qui est dirigée sur le chromosome par des motifs, les KOPS, dont l'orientation s'inverse à dif. De ce fait, elle est toujours dirigée vers le site de recombinaison où elle active la machinerie permettant la résolution des dimères de chromosomes. Des homologues des protéines XerC, XerD et FtsK, ainsi qu'un site dif, sont retrouvés chez un grand nombre de bactéries, suggérant que la machinerie ainsi que le contrôle de la recombinaison sont conservés. Cependant, chez les Streptocoques, la machinerie de recombinaison implique une seule recombinase, XerS, qui agit sur un site atypique, difSL. Ce manuscrit concerne l'étude du mécanisme et du contrôle de la recombinaison Xer chez la bactérie Lactococcus lactis appartenant à la famille des Streptocoques. Dans une première partie, nous mettons en évidence in vitro que l'implication d'une seule recombinase ne modifie pas le mode de fixation et de recombinaison au site, en comparaison au système Xer " classique " d'E. coli. D'autre part, nous montrons in vivo que le système est contrôlé par la protéine FtsK mais que le mode d'activation de la recombinaison est différent de celui décrit chez E. coli. Dans une deuxième partie nous nous intéressons au mode d'orientation de la protéine FtsK de L.lactis. Nous mettons en évidence par une combinaison d'approches in vivo, in vitro et in silico, que la reconnaissance de motifs biaisés sur le chromosome est conservée mais que la taille et la séquence du motif reconnu diffère des systèmes déjà décrits.

Sous la direction du :
Directeur de thèse
Cornet, François
Le Bourgeois, Pascal
Ecole doctorale:Biologie, santé, biotechnologies (BSB)
laboratoire/Unité de recherche :Laboratoire de Microbiologie et Génétique Moléculaires (LMGM), UMR 5100
Mots-clés libres :Recombinaison spécifique de site - Recombinase à tyrosine - Streptocoques - Dimères de chromosome - Translocation de l'ADN - Recombinaison Xer
Sujets :Sciences du vivant
Déposé le :28 Oct 2011 13:59