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Bastiat, Bénédicte. Identification et caractérisation de facteurs sigma impliqués dans le contrôle de réponses aux stress chez Sinorhizobium meliloti

Bastiat, Bénédicte (2011). Identification et caractérisation de facteurs sigma impliqués dans le contrôle de réponses aux stress chez Sinorhizobium meliloti.

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Résumé en francais

Sinorhizobium meliloti est une a-protéobactérie du sol capable d'établir une symbiose fixatrice d'azote avec des plantes légumineuses comme Medicago truncatula. Dans le sol et in planta, la bactérie est soumise à de multiples stress. Pour les surmonter, elle met en place des réponses aux stress dont certaines ont été étudiées au cours de cette thèse. Le facteur sigma RpoE2 est le régulateur transcriptionnel de la réponse générale aux stress chez S. meliloti. La première partie de cette thèse a consisté à caractériser les mécanismes d'activation de RpoE2 en réponse aux stress. Des approches " gènes candidats " ont permis de montrer que l'activité de RpoE2 était négativement régulée par deux antisigmas et positivement par deux anti-antisigmas qui agissent par un mécanisme de "partner-switching". Une approche génétique a ensuite été initiée pour rechercher de nouveaux acteurs de la cascade d'activation de RpoE2. La deuxième partie de cette thèse avait pour objectif d'identifier d'autres facteurs sigma impliqués dans les réponses aux stress chez S. meliloti. Une approche de type tap-tag couplée à la spectrométrie de masse a été utilisée pour identifier les facteurs sigma en interaction avec l'ARN polymérase dans différentes conditions de croissance. Cette approche a révélé que RpoE2 mais aussi trois autres facteurs sigma RpoE1, RpoE3 et RpoE4 ainsi qu'un facteur sigma de stress thermique RpoH2 étaient activés à l'entrée en phase stationnaire. RpoE1 et RpoE4 ont été caractérisés et s'avèrent impliqués dans la réponse de S. meliloti au sulfite. Un résultat préliminaire suggère que RpoH2, comme RpoE2, serait un autre régulateur de la réponse générale aux stress chez S. meliloti.

Sous la direction du :
Directeur de thèse
Bruand, Claude
Ecole doctorale:Sciences écologiques, vétérinaires, agronomiques et bioingénieries (SEVAB)
laboratoire/Unité de recherche :Laboratoire des Interactions Plantes Micro-organismes (LIPM)
Mots-clés libres :Facteurs sigma ECF - ARN polymérase - Réponse générale aux stress - Sulfite - Anti-antisigma - Sulfite oxidase - Régulateur de réponse - Tap-Tag
Sujets :Sciences du vivant
Déposé le :14 May 2012 14:15