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Lavatine, Laure. Transposition simple brin de la séquence d'insertion bactérienne IS608 : étude du ciblage de la transposase TnpA sur les fourches de réplication arrêtées

Lavatine, Laure (2012). Transposition simple brin de la séquence d'insertion bactérienne IS608 : étude du ciblage de la transposase TnpA sur les fourches de réplication arrêtées.

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Résumé en francais

Les éléments transposables ont un rôle majeur dans la plasticité et l'évolution des génomes bactériens. Les séquences d'insertion bactériennes de la famille IS200/IS605, très présentes chez les Eubactéries et les Archaea, codent une transposase de type Y1 et possèdent un mécanisme de transposition atypique, mettant en jeu exclusivement des intermédiaires ADN sous forme simple brin. Différents processus cellulaires génèrent de l'ADN simple brin, comme la réplication ou le transfert conjugatif. L'équipe a récemment mis en évidence un lien entre la transposition d'IS608, un membre de la famille IS200/IS605, et la réplication du chromosome de l'hôte : la transposition d'IS608 est renforcée au niveau des fourches de réplications arrêtées. Notre étude concerne la caractérisation du ciblage des fourches de réplication arrêtées par la transposase TnpA d'IS608. Nos travaux in vivo ont montré que TnpA est localisée au niveau des fourches, arrêtées par un système opérateur/répresseur placé sur le chromosome. La méthode de purification de complexes natifs employée (TAP-tag) ne nous a pas permis de mettre en évidence de partenaire protéique impliqué dans ce ciblage. In vitro, TnpA est capable d'interagir avec divers substrats ADN structurés, mimant des structures produites in vivo par les systèmes de redémarrage, tels qu'une fourche, une D-loop ou une jonction de Holliday. Ces données suggèrent un modèle d'action dans lequel TnpA ciblerait les sites de redémarrage des fourches, avant de " glisser " vers ses substrats cibles simple brin et de catalyser l'intégration d'IS608.

Sous la direction du :
Directeur de thèse
Chandler, Michael
Ton-Hoang, Bao
Ecole doctorale:Biologie, santé, biotechnologies (BSB)
laboratoire/Unité de recherche :Laboratoire de Microbiologie et Génétique Moléculaires (LMGM), UMR 5100
Mots-clés libres :Séquence d'insertion - Transposition simple brin - Réplication - Redémarrage de fourche
Sujets :Sciences du vivant
Déposé le :08 Jul 2013 11:09