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Pinzon Restrepo, Natalia. Characterization of regulatory noncoding RNAs : the U1 small nuclear RNA and Cajal body-specific box C/D guide RNAs

Pinzon Restrepo, Natalia (2011). Characterization of regulatory noncoding RNAs : the U1 small nuclear RNA and Cajal body-specific box C/D guide RNAs.

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Résumé en francais

Les cellules contiennent de nombreux ARNs non-codants qui jouent un rôle essentiel dans toutes les étapes de l'expression génique. Nos travaux concernent la caractérisation de possibles nouvelles fonctions associés à deux classes d'ARNs non-codants : l'ARN U1 et les scaARNs. Le petit ARN nucléaire U1 forme une ribonucléoparticule (snRNP U1) qui joue un rôle clé dans l'épissage des ARN pré-messagers. De plus, l'ARN U1 semble intervenir dans d'autres étapes de la synthèse des ARNm fonctionnels. Nos travaux ont démontré qu'une fraction de l'ARN U1 interagit spécifiquement avec la protéine TAF15, dans un complexe qui diffère dans sa composition protéique de la particule d'épissage canonique Sm snRNP U1. Nous avons constaté qu'à la différence de la particule d'épissage, la snRNP U1-TAF15 est fortement attachée à la chromatine. De plus, suite à l'arrêt de la transcription par l'ARN polymérase II, la particule U1-TAF15 se relocalise dans la coiffe périnucléolaire, à l'opposé de la particule Sm snRNP U1 qui s'accumule alors dans les "speckles". Une étude protéomique de la particule U1-TAF15 nous a permis d'établir des hypothèses quant à sa fonction qui sont actuellement à l'étude dans le laboratoire. Récemment, une protéine essentielle à l'adressage des scaARNs (ARNs spécifiques des Corps de Cajal) dans les Corps de Cajal a été identifiée (Tycowski et al., 2009; Venteicher et al., 2009). Une analyse par séquençage à haut-débit de l'ensemble des petits ARNs associés à WDR79 a permis d'identifier de nombreux nouveaux scaARNs putatifs. Parmi eux, l'analyse de deux ARNs à boite C/D a défini des structures essentielles pour leur localisation dans les corps de Cajal. Des études plus approfondies devraient nous permettre de déterminer des éléments spécifiques nécessaires à l'adressage des scaARNs à boite C/D vers les corps de Cajal. Par ailleurs, nous avons commencé la caractérisation d'un nouveau scaARN qui ciblerait la modification d'un ARN de transfert. Alors que les ARN C/D connus chez les Eucaryotes participent à la biogenèse des ARN ribosomiques et des petits ARN nucléaires, nous avons identifié pour la première fois chez les Eucaryotes un ARN C/D qui ciblerait un ARN de transfert.

Sous la direction du :
Directeur de thèse
Kiss, Tamas
Ecole doctorale:Biologie, santé, biotechnologies (BSB)
laboratoire/Unité de recherche :Laboratoire de Biologie Moléculaire Eucaryote (LBME), UMR 5099
Mots-clés libres :Noncoding RNA - SnRNA - TAF15 - Box C/D RNA
Sujets :Sciences du vivant
Déposé le :15 Dec 2014 11:47