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Zedane, Loubab. Phylogenetic hypothesis of the Oleeae tribe (Oleaceae): diversification and molecular evolution patterns in plastid and nuclear ribosomal DNA

Zedane, Loubab (2016). Phylogenetic hypothesis of the Oleeae tribe (Oleaceae): diversification and molecular evolution patterns in plastid and nuclear ribosomal DNA.

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Résumé en francais

La tribu d'Oleeae (Oleaceae) est un modèle biologique très intéressant pour étudier la diversification et les patterns d'évolution moléculaire chez les plantes. Les reconstitutions de l'histoire évolutive et phylogénétique des relations entre ses espèces ont été au cœur de cette thèse. Ce travail a conduit à des progrès significatifs dans la résolution des relations phylogénétiques au sein de la tribu à différents niveaux taxonomiques. Nous avons démontré que l'utilisation d'une approche de "Genome Skimming" est très appropriée pour générer plastomes complets (ptDNA) et de l'ADN ribosomal nucléaire (nrDNA), même sur un échantillon d'herbier. Nous avons montré l'utilité du ptDNA pour reconstruire la première ossature phylogénétique robuste pour la tribu, et fourni de nouvelles connaissances sur l'histoire biogéographique et sur l'évolution de certains traits. Nous avons aussi montré que l'évolution de la composition en bases du nrDNA peut être influencée par des facteurs climatiques.

Sous la direction du :
Directeur de thèse
Besnard, Guillaume
Ecole doctorale:Sciences écologiques, vétérinaires, agronomiques et bioingénieries (SEVAB)
laboratoire/Unité de recherche :Laboratoire Evolution et Diversité Biologique, UMR 5174
Mots-clés libres :Phylogénie - Oleeae - Oleaceae - Biogéographie - Diversification - Plastome génome - ADN ribosomique nucléaire - Teneur de GC - Assemblage du génome - Evolution moléculaire - Taxonomie
Sujets :Sciences du vivant
Déposé le :03 Feb 2017 17:46