Dupouy, Christelle. Synthèses, structures et propriétés de dinucléotides à conformation contrainte

Résumé en francais

Nous organisons un brin d’acide nucléique par introduction sur le squelette sucre-phosphate, de dinucléotides comportant un cycle (1,3,2)-dioxaphosphorinane, appelés D-CNA. Le cycle à six chainons contraint les angles de torsion (alpha-zêta) du squelette à des valeurs fixes, canoniques ou non des structures doubles hélices des ADNs. La synthèse des alpha,bêta-D-CNA (g-, t) et (g+, t) a été optimisée et étendue au LNA/alpha,bêta-D-CNA. Des dinucléotides contraints au niveau des angles de torsion epsilon et zêta ont été préparés : les nu2,epsilon,zêta-D-CNA, les (2’,5’),nu2,epsilon',zêta'-D-CNA et les xylo-epsilon,zêta-D-CNA. Les propriétés induites par les alpha,bêta-D-CNA (g-, t) et (g+, t) dans des oligonucléotides ont été évaluées. La modification canonique alpha,bêta-D-CNA (g-, t) favorise la formation de duplex (deltaTm = +5°C/mod). L’incorporation de l’alpha,bêta-D-CNA (g+, t) avec une valeur atypique de l’angle alpha, stabilise des tige-boucles par préorganisation de la partie boucle non appariée. L’ensemble des D-CNA pourra conduire à l’élaboration de structures d’acides nucléiques hélicoïdales ou non.