Clara, Etienne De (2015). Etude des longs ARNs non codants dans la leucémie aiguë myéloblastique à caryotype normal.
Résumé en francais
Les longs ARN non codants (lncRNAs) sont définis comme des transcrits de plus de 200nt et n'ayant pas de potentiel codant.
Des études récentes ont démontré que les lncRNAs pouvaient être impliqués dans la régulation de la transcription, de la
traduction, de la différenciation cellulaire, de l'expression génique, du cycle cellulaire et des modifications de la
chromatine. De plus, il a été montré un impact fonctionnel de certains lncRNAs dans le processus de cancérogenèse mais nos
connaissances actuelles sur ces molécules dans le cancer, et plus particulièrement dans la leucémie, restent extrêmement
limitées. Au cours de cette étude, nous avons analysé l'expression des lncRNAs par RNA-sequencing sur 40 patients atteints de
leucémie aiguë myéloblastique (LAM) à caryotype normal. Parmi les 11065 lncRNAs exprimés dans nos échantillons, nous avons
identifié une signature de lncRNAs associée à la mutation de NPM1. Afin de mettre en évidence les fonctions putatives des
lncRNAs sélectionnés, nous avons utilisé un algorithme de prédiction d'interaction protéine/ARN. De manière intéressante,
plus de la moitié des lncRNAs présentent des sites d'interactions potentiels à SUZ12, une sous unité du complexe PRC2
(Polycomb repressive complex 2), connu pour être recruté par des lncRNAs pour la régulation épigénétique de gènes cibles. Par
RNA immunoprécipitation (RIP) de SUZ12, nous avons pu démontrer que le lncRNA XLOC_087120 interagissait avec SUZ12. De plus,
son expression est anti-corrélée avec celle des gènes voisins codants des histones, suggérant un rôle dans la régulation
négative des histones par ce lncRNA. L'impact de la dérégulation de XLOC_087120 sur les histones a été confirmé par des
expériences de surexpression et d'inhibition de ce lncRNA dans des lignées de LAM. De plus, même si la mutation NPM1 ne
semble pas affecter directement l'expression de ce lncRNA, des expériences d'infection de la forme mutée de NPM1 dans une
lignée LAM ont montré que NPM1 pourrait réguler la localisation nucléaire/cytoplasmique de XLOC_087120 et moduler sa fonction
de répresseur. En conclusion, ces données suggèrent que les lncRNAs sont des facteurs clés dans la pathogenèse des LAMs.
Sous la direction du : | Directeur de thèse |
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Brousset, Pierre | Bousquet, Marina |
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Ecole doctorale: | Biologie, santé, biotechnologies (BSB) |
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laboratoire/Unité de recherche : | Centre de Recherche en Cancérologie de Toulouse (CRCT), UMR 1037 |
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Mots-clés libres : | Leucémie aiguë myéloblastique - Long ARN non codant - RNA-sequencing - Régulation épigénétique |
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Sujets : | Sciences du vivant |
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Déposé le : | 22 May 2018 14:23 |
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