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Guynet, Catherine. Etude du mécanisme de transposition de la Séquence d'Insertion bactérienne IS608

Guynet, Catherine (2008). Etude du mécanisme de transposition de la Séquence d'Insertion bactérienne IS608.

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Résumé en francais

Les transposons jouent un rôle fondamental dans la plasticité et l'évolution des génomes bactériens. Ce mémoire concerne l'étude du mécanisme de transposition de l'un d'entre eux, la séquence d'insertion IS608 isolée chez Helicobacter pylori. IS608 appartient à une famille de transposons atypiques, le groupe IS200/IS605, dont les membres sont fortement représentés chez les eubactéries et les archae. Nos travaux mettent en évidence une nouvelle classe de transposases et un mécanisme de transposition inédit. Nous montrons que, à la différence de tous les autres systèmes de transposition connus, la transposase d'IS608 est active uniquement sur un ADN simple brin. Nous avons développé un système de recombinaison qui reconstitue toute les étapes de clivages et transferts de brin nécessaires à la transposition d'IS608 in vitro. TnpA ne ressemble à aucune transposase caractérisée, mais s'apparente aux endonucléases de la superfamille HUH, qui inclue des protéines impliquées dans l'initiation de la réplication en cercle roulant et la réplication de certains virus eucaryotes (protéines Rep), et dans le transfert de plasmides conjugatifs (relaxases). Nous montrons que la fixation d'un ADN approprié induit l'activation de TnpA, sélectionne le site de clivage, et dirige l'intégration dans une cible spécifique. Ces résultats apportent des éléments concernant la sélection de la séquence cible, et nous possédons les outils permettant de modifier la spécificité d'insertion de l'élément.

Sous la direction du :
Directeur de thèse
Chandler, Michael
Ton-Hoang, Bao
Ecole doctorale:Biologie, santé, biotechnologies (BSB)
laboratoire/Unité de recherche :Laboratoire de Microbiologie et Génétique Moléculaires (LMGM), UMR 5100
Mots-clés libres :recombinaison - plasticité génomique - transposition - séquence d'insertion - ADN simple brin - transposase - cristallographie - spécificité d'insertion
Sujets :Sciences du vivant
Déposé le :07 Jul 2009 14:33