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Van de Paer, Céline. Diversité structurelle et évolution contrastée des génomes cytoplasmiques des plantes à fleurs : une approche phylogénomique chez les Oleaceae

Van de Paer, Céline (2017). Diversité structurelle et évolution contrastée des génomes cytoplasmiques des plantes à fleurs : une approche phylogénomique chez les Oleaceae.

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Résumé en francais

Chez les plantes, la dynamique structurelle et l'évolution concertée des génomes nucléaire et cytoplasmiques restent peu documentées. L'objectif de cette thèse était d'étudier la diversité structurelle et l'évolution des mitogénomes et des plastomes chez les Oleaceae à l'aide d'une approche de phylogénomique. Nous avons d'abord assemblé des mitogénomes à partir de données de séquençage de faible couverture, obtenues à partir de matériel frais et d'herbier. Une grande variation de structure du mitogénome a été observée chez l'olivier, et un gène chimérique potentiellement associé à un type de stérilité mâle a été identifié. Enfin, nous avons étudié l'évolution des plastomes et des gènes mitochondriaux chez les Oleaceae. Une accélération de l'évolution du plastome a été observée dans deux lignées indépendantes. Ce changement de trajectoire évolutive pourrait être la conséquence d'une transmission occasionnelle de plastes par le pollen, modifiant les pressions sélectives sur certains gènes.

Sous la direction du :
Directeur de thèse
Besnard, Guillaume
Ecole doctorale:Sciences écologiques, vétérinaires, agronomiques et bioingénieries (SEVAB)
laboratoire/Unité de recherche :Laboratoire Evolution et Diversité Biologique, UMR 5174
Mots-clés libres :Oleaceae - Olea europaea - Mitogenome - Paternal leakage - Phylogénomique
Sujets :Sciences du vivant
Déposé le :27 Mar 2019 14:53