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Oudinet, Chloé. Mécanismes transcriptionnels et épigénétiques dans la régulation de l'expression du locus IgH murin au cours du développement des lymphocytes B

Oudinet, Chloé (2020). Mécanismes transcriptionnels et épigénétiques dans la régulation de l'expression du locus IgH murin au cours du développement des lymphocytes B.

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Résumé en francais

Les lymphocytes B sont les seules cellules du système immunitaire capables de produire des immunoglobulines (Ig). La vaste diversité et la haute spécificité des Ig produites sont l'aboutissement de multiples mécanismes cellulaires et moléculaires incluant des processus recombinationnels et mutationnels au sein des loci des chaînes lourdes et légères des immunoglobulines. Ces loci sont soumis à de multiples niveaux de régulation tout au long du développement des cellules B impliquant des mécanismes épigénétiques et transcriptionnels qui orchestrent l'activation progressive et ordonnée de ces loci. Au cours de ma thèse, je me suis intéressée à deux processus recombinationnels dans le locus des chaînes lourdes des Ig (locus IgH) : la recombinaison V(D)J et la commutation de classe (CSR). Les deux processus requièrent la transcription des séquences cibles. Cette transcription, dite transcription germinale, joue un rôle important dans la régulation de l'accessibilité des séquences cibles aux enzymes initiant les deux processus. Spécifiquement, j'ai étudié 3 aspects de la régulation de l'expression du locus IgH murin au cours du développement précoce et tardif des cellules B : 1) Le rôle de la transcription germinale dans la régulation de la recombinaison V(D)J. La recombinaison V(D)J est initiée au sein de "centres de recombinaison" riches en activité transcriptionnelle, mais la relation causale entre transcription et recombinaison demeure controversée. En utilisant un modèle murin et un système d'analyse de la transcription et de la recombinaison au niveau de la cellule unique, j'ai montré que la recombinaison V(D)J pouvait se produire au sein des centres de recombinaison en l'absence de transcription détectable, suggérant fortement que ces deux processus sont contrôlés par des mécanismes distincts. 2) Le rôle de la méthylation de l'ADN dans la transcription germinale associée à la CSR. Le rôle précis de cette modification épigénétique dans la régulation de la transcription germinale est inconnu. J'ai effectué une analyse longitudinale des profils de méthylation de différents éléments cis-régulateurs du locus IgH dans des cellules primaires de différentes lignées murines. J'ai montré que dans la lignée B, les profils de méthylation de la majorité de ces éléments étaient établis et maintenus indépendamment de l'activation des cellules B ou de la transcription germinale, et que certains promoteurs étaient hypométhylés tôt au cours du développement embryonnaire, bien avant l'apparition du lignage B, suggérant un rôle potentiel de la méthylation de l'ADN dans le pré-marquage épigénétique du locus plutôt que dans la régulation de son expression. Les bases moléculaires de la spécificité de la séquence Sµ. La CSR implique une recombinaison entre la séquence Sµ, site donneur universel de commutation, et une séquence partenaire en aval. Plusieurs données suggèrent que la séquence Sµ a des propriétés qui la distinguent des autres séquences S, mais les bases moléculaires de cette spécificité sont inconnues. J'ai utilisé un modèle murin où une séquence S en aval a été placée sous le contrôle des éléments qui régulent la transcription de la région Sµ. J'ai montré que parmi les différents facteurs impliqués dans la spécificité de Sµ, la proximité d'un enhancer jouait un rôle important et suffisait à conférer à la séquence S en aval la fonction de site donneur de CSR.

Sous la direction du :
Directeur de thèse
Khamlichi, Ahmed Amine
Ecole doctorale:Biologie, santé, biotechnologies (BSB)
laboratoire/Unité de recherche :Institut de Pharmacologie et de Biologie Structurale (IPBS), UMR 5089
Mots-clés libres :Locus IgH - Lymphocytes B - Transcription - Epigénétique - Recombinaison V(D)J - Recombinaison de classe - Translocations chromosomiques
Sujets :Sciences du vivant
Déposé le :08 Apr 2021 16:11